More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0256 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  76.1 
 
 		 411 aa  664    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 411 aa  847    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 		 410 aa  551  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 418 aa  531  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0778  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  62.97 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  62.31 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 422 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  60.84 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  62.91 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.19 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.75 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 416 aa  511  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.25 
 
 		 418 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.75 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  59.45 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 410 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.25 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 423 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  59.55 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  63.85 
 
 		 438 aa  501  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  61.83 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 411 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  60.74 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  63.85 
 
 		 438 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 		 420 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.7 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.45 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.45 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 426 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.95 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  59.5 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  60.8 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 421 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.95 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  59.45 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  59.35 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 423 aa  498  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  59.25 
 
 		 411 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 416 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.04 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  59.5 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  63.25 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12140  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  59.25 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 412 aa  494  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>