140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0229 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  53.97 
 
 
191 aa  224  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
197 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
197 aa  210  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
197 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
197 aa  209  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  51.6 
 
 
206 aa  208  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
193 aa  207  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  57.14 
 
 
189 aa  204  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  48.4 
 
 
189 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
190 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
190 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
190 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
190 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  200  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
189 aa  197  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
188 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
192 aa  194  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
192 aa  194  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
192 aa  188  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 
197 aa  186  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
191 aa  176  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  44.75 
 
 
192 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  46.33 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
193 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
192 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
202 aa  115  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  30.69 
 
 
798 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  31.79 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  28.57 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  32.26 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  26.62 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  24.68 
 
 
274 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  28 
 
 
274 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  29.68 
 
 
274 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  29.68 
 
 
274 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  29.79 
 
 
282 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
264 aa  62  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0563  adenine phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
242 aa  61.2  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0138344 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  25.81 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  26.06 
 
 
280 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  26.17 
 
 
274 aa  58.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  27.1 
 
 
272 aa  57.8  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  24.16 
 
 
270 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  29.03 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  23.57 
 
 
271 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1543  pur operon repressor  24.49 
 
 
284 aa  55.8  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
177 aa  54.7  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  22.82 
 
 
281 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  29.03 
 
 
270 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  25 
 
 
267 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 
424 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  24.19 
 
 
267 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0086  phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
235 aa  51.2  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  24.29 
 
 
277 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  23.83 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0083  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.448882  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2871  phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
175 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14411  adenine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  25.19 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  25.19 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 
248 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
182 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>