38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0172 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  100 
 
 		 287 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  41.46 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  37.37 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  36.52 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  37.5 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  35.44 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  35.44 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  34.75 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  34.75 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  35.44 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  35.97 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  34.74 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  31.29 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  30.94 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  30.94 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  30.94 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  30.94 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  30.94 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  30.94 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  31.6 
 
 		 285 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  31.3 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  32.06 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  31.15 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  31.6 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  31.84 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  31.84 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  32.16 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  30 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  27.12 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  30.25 
 
 		 251 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  23.93 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  27.34 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>