More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0162 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  61.41 
 
 
609 aa  734    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 
608 aa  1215    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  40.98 
 
 
614 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  40.98 
 
 
614 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  39.77 
 
 
614 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.34 
 
 
609 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.34 
 
 
609 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.17 
 
 
609 aa  379  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.11 
 
 
609 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  37.11 
 
 
609 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  37.11 
 
 
609 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  37.11 
 
 
609 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.11 
 
 
609 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  37.34 
 
 
609 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.13 
 
 
609 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  37.25 
 
 
611 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  37.13 
 
 
609 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.9 
 
 
484 aa  197  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  36.64 
 
 
484 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 
402 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
398 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 
389 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  27.61 
 
 
375 aa  107  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 
416 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 
557 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 
385 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  25.64 
 
 
719 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
530 aa  95.1  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 
688 aa  94.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.89 
 
 
386 aa  90.9  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 
378 aa  90.5  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 
389 aa  90.1  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.74 
 
 
387 aa  90.1  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  21.95 
 
 
620 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.95 
 
 
620 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  21.95 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.95 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.95 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.95 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  21.95 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
406 aa  87.8  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.95 
 
 
620 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.42 
 
 
388 aa  87  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
389 aa  87.4  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.95 
 
 
620 aa  87  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
751 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
722 aa  86.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 
715 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  22.32 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  25.37 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.8 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
721 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 
679 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 
388 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 
712 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  23.62 
 
 
709 aa  79.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.83 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.83 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25.43 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.83 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24.83 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.2 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.83 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  25.9 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1761  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.02 
 
 
534 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 
387 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
387 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  21.5 
 
 
617 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  25.63 
 
 
589 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
698 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.32 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 
698 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  26.01 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.86 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  26.01 
 
 
589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.99 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.81 
 
 
589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  23.8 
 
 
392 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  23.61 
 
 
689 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.11 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
686 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.08 
 
 
387 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.14 
 
 
375 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.75 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  24.56 
 
 
589 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.75 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.74 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  24.62 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.37 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 
716 aa  70.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>