220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0153 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  51.22 
 
 
666 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  49.93 
 
 
760 aa  675    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  54.45 
 
 
665 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  54.27 
 
 
657 aa  713    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  51.73 
 
 
673 aa  681    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  51.52 
 
 
671 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  100 
 
 
682 aa  1387    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  49.55 
 
 
677 aa  670    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  47.87 
 
 
650 aa  609  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  44.85 
 
 
834 aa  607  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  47.02 
 
 
661 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  47.09 
 
 
650 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  42.16 
 
 
877 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  44.38 
 
 
648 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  44.89 
 
 
650 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  42.31 
 
 
646 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  42.41 
 
 
657 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  44.11 
 
 
655 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  42.9 
 
 
655 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  39.38 
 
 
651 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  46.21 
 
 
454 aa  382  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  43.7 
 
 
630 aa  326  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  34.89 
 
 
637 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  38.8 
 
 
633 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  38.12 
 
 
633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  34.49 
 
 
632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  37.98 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  37.21 
 
 
647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  34.34 
 
 
632 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  36.19 
 
 
633 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  33.7 
 
 
637 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  41.18 
 
 
651 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  36.46 
 
 
647 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  39.22 
 
 
634 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  37.15 
 
 
636 aa  300  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  35.99 
 
 
634 aa  300  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  40.96 
 
 
651 aa  299  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  37.45 
 
 
622 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  40.74 
 
 
651 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  36.38 
 
 
633 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  34.29 
 
 
633 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  36.62 
 
 
642 aa  297  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  32.2 
 
 
655 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  41.04 
 
 
629 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  36.44 
 
 
642 aa  295  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  39.42 
 
 
611 aa  295  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  38.04 
 
 
643 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  41.34 
 
 
629 aa  293  7e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  38.76 
 
 
625 aa  293  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  40.56 
 
 
637 aa  293  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  36.33 
 
 
647 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  37.72 
 
 
634 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  33.54 
 
 
646 aa  290  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  40.47 
 
 
636 aa  289  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  37.25 
 
 
630 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  39.06 
 
 
661 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  38.43 
 
 
637 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  33.5 
 
 
625 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  38.31 
 
 
641 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  33.68 
 
 
658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  34.15 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  35.37 
 
 
643 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  39.7 
 
 
637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  36.74 
 
 
656 aa  284  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  35.18 
 
 
639 aa  284  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  37.28 
 
 
637 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  38.8 
 
 
630 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  32.81 
 
 
652 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  33.09 
 
 
664 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  38.58 
 
 
614 aa  281  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  42.26 
 
 
656 aa  281  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  32.91 
 
 
641 aa  280  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  39.16 
 
 
672 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  40.65 
 
 
632 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  37.19 
 
 
632 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  34.46 
 
 
650 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  39.6 
 
 
640 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  37.78 
 
 
626 aa  276  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  35.66 
 
 
624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  32.2 
 
 
631 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  32.2 
 
 
631 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  36.92 
 
 
680 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  39.28 
 
 
631 aa  273  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2064  hypothetical protein  35.86 
 
 
625 aa  273  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2054  hypothetical protein  36.06 
 
 
624 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  32.23 
 
 
628 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  38.12 
 
 
640 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  33.02 
 
 
633 aa  272  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  37.55 
 
 
634 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  38.77 
 
 
622 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  33.39 
 
 
630 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  41.31 
 
 
657 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  32.77 
 
 
613 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  37.34 
 
 
634 aa  271  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  31.16 
 
 
628 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  39.01 
 
 
640 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  37.58 
 
 
627 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  38.28 
 
 
631 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  35.21 
 
 
622 aa  270  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  37.88 
 
 
629 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>