More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0148 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  39.23 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  36.57 
 
 
305 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 
303 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  37.83 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.06 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  39.86 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  34.53 
 
 
303 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.65 
 
 
304 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  35.18 
 
 
303 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 
303 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 
303 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 
303 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  39.51 
 
 
306 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.39 
 
 
303 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
303 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 
307 aa  175  7e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 
302 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  37.37 
 
 
303 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  37.29 
 
 
300 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0161  fructose-1-phosphate kinase-like protein  35.47 
 
 
276 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.011677  unclonable  2.34449e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
306 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  34.42 
 
 
305 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
338 aa  158  9e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 
306 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 
306 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 
303 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
304 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  30.91 
 
 
305 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
324 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.49 
 
 
307 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.17 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  33.57 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  30 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 
315 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 
311 aa  142  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 
308 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.08 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 
315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  30.89 
 
 
315 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.79 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  35.21 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  31.43 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2661  1-phosphofructokinase  32.41 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  30.43 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  29.94 
 
 
310 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.82 
 
 
315 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.66 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
323 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  29.3 
 
 
317 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  28.91 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  30.93 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  28.03 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  31.11 
 
 
308 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 
312 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  32.54 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  32.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  26.21 
 
 
315 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  27.7 
 
 
319 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  31.61 
 
 
311 aa  127  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.02 
 
 
311 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  31.02 
 
 
313 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  27.01 
 
 
319 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
312 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
312 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
312 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
312 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  31.86 
 
 
312 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  27.01 
 
 
319 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
312 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  28.94 
 
 
324 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  28.17 
 
 
315 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  29.92 
 
 
311 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  29.73 
 
 
313 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  28.43 
 
 
303 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  31.68 
 
 
312 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.81 
 
 
311 aa  122  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  26.37 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  28.17 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1103  1-phosphofructokinase  28.8 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  30.85 
 
 
312 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  30.51 
 
 
312 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  29.18 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>