More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0140 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  52.27 
 
 
133 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  43.69 
 
 
106 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  46.32 
 
 
107 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  47.57 
 
 
113 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  45.28 
 
 
110 aa  95.5  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  49.47 
 
 
104 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  46.73 
 
 
121 aa  93.2  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  48.42 
 
 
110 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  50.5 
 
 
101 aa  91.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  38.83 
 
 
160 aa  89  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  38.83 
 
 
164 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  39.18 
 
 
156 aa  85.5  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.86 
 
 
105 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  37.25 
 
 
108 aa  84.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  37.89 
 
 
102 aa  84.7  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  44.44 
 
 
119 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  42.16 
 
 
131 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  42.86 
 
 
117 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  43.14 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  39.05 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  37.04 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  40.2 
 
 
122 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  41.75 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  39.8 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  43.16 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40.2 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  41.94 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  40.2 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  40.2 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  41.84 
 
 
127 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.24 
 
 
102 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.33 
 
 
99 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.53 
 
 
100 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  43.88 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  38.95 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  41.84 
 
 
127 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  40.2 
 
 
122 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  42.57 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.04 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.04 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.04 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  40.59 
 
 
126 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  38.54 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  40.2 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  38.14 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  38.14 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  40.2 
 
 
136 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  41 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  38.54 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 
126 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.66 
 
 
100 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  40.82 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  40.82 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  41.94 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  40.82 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  39.39 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  40.2 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  40.82 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  38.78 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  37.62 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  42.11 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.25 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  39.8 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  39.8 
 
 
135 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.77 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  35.78 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 
142 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  42.31 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  37.25 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  38.95 
 
 
100 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  37.62 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  35.14 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  36.63 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  38.14 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>