More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0128 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 		 164 aa  337  5e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  48.43 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  46.67 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  42.76 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  41.45 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  41.94 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  41.72 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.33 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  39.87 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  35.76 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  35.1 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  37.33 
 
 		 150 aa  94.4  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  38.51 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.1 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  32.05 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.16 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.56 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.7 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.46 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.57 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.25 
 
 		 307 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  31.69 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.19 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.52 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.99 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.22 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33.54 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.41 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.82 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.71 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.94 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.78 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  31.76 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.8 
 
 		 297 aa  63.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.72 
 
 		 286 aa  63.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.87 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  31.48 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  30.41 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  26.58 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  29.25 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.7 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.41 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  26.49 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.82 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  27.7 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.72 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.76 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.97 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.63 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.38 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.8 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.73 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  29.14 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.83 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  30 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.73 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  25.68 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>