31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0104 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0104  transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000798599  hitchhiker  0.000000102912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  26.04 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25.25 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03680  transcriptional regulator, tetR family  27.34 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3536  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.03 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.03 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.03 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 201 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 234 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  27.47 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>