More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0091 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
237 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 
232 aa  221  9e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0337  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  43.1 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00956339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  41.23 
 
 
233 aa  169  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  37.44 
 
 
248 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  35.54 
 
 
243 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  39.38 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  34.05 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  34.05 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  38.74 
 
 
246 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  36.78 
 
 
246 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 
237 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  35.19 
 
 
241 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  34.87 
 
 
244 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  34.87 
 
 
244 aa  132  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  34.06 
 
 
252 aa  131  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  37.61 
 
 
244 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 
256 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  34.23 
 
 
254 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  32.37 
 
 
242 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 
245 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.77 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  30.27 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.36 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  30.86 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  32.84 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  33.89 
 
 
245 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  34.27 
 
 
257 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36 
 
 
253 aa  113  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  32.18 
 
 
269 aa  113  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  32.11 
 
 
245 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  33.82 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  30.83 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  30.51 
 
 
230 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.62 
 
 
245 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  35.32 
 
 
234 aa  109  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  33.78 
 
 
256 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.68 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  34.6 
 
 
260 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  34.44 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  31.9 
 
 
256 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  32.86 
 
 
242 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  34.02 
 
 
248 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  29.2 
 
 
244 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.71 
 
 
251 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  34.65 
 
 
248 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  31.9 
 
 
237 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  35.19 
 
 
250 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  28.87 
 
 
253 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  30.26 
 
 
250 aa  105  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  33.63 
 
 
247 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  35.41 
 
 
249 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  32.86 
 
 
249 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  31.6 
 
 
248 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30 
 
 
233 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  35.44 
 
 
249 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  32.38 
 
 
249 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  31.22 
 
 
243 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  31.43 
 
 
241 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  29.95 
 
 
259 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  33.67 
 
 
254 aa  101  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 
245 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 
245 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  33.94 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  33.78 
 
 
245 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  31.58 
 
 
244 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  33.18 
 
 
241 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  30.41 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  32.41 
 
 
238 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  33.03 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  30.32 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  29.86 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  29.22 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  33.49 
 
 
246 aa  99  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  33.49 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  32.13 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  27.66 
 
 
251 aa  98.2  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  32.27 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  29.82 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  29.61 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  29.29 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  32.88 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  34.23 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.57 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  30.58 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  29.08 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  31.91 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  30.63 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  30.99 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  33.01 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0479  Silent information regulator protein Sir2  32.57 
 
 
248 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  33.02 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  33.02 
 
 
237 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  30.41 
 
 
248 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  33.02 
 
 
237 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  31.03 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  31.36 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  26.32 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>