62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0084 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0084  restriction endonuclease  100 
 
 
309 aa  639    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  37.63 
 
 
459 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  36.56 
 
 
459 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  26.72 
 
 
1138 aa  52.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  33 
 
 
174 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  32.86 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  32.84 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  32.84 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  32.84 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40.91 
 
 
169 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  37.04 
 
 
164 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  42.11 
 
 
171 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  35 
 
 
169 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  31.88 
 
 
166 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  38.18 
 
 
162 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.6 
 
 
172 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  30.43 
 
 
166 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  41.07 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  38.6 
 
 
170 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  36.67 
 
 
471 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  38.6 
 
 
146 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.29 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  31.34 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  35 
 
 
205 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  38.46 
 
 
179 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  29.41 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  30.61 
 
 
173 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  38.89 
 
 
443 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  33.33 
 
 
178 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  36.67 
 
 
459 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  28.77 
 
 
166 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  23.02 
 
 
221 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  40.91 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  38.64 
 
 
169 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  38.64 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  27.59 
 
 
160 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  37.5 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  33.33 
 
 
1187 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  35.29 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  38.6 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  29.47 
 
 
481 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  35 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  31.08 
 
 
181 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  32.84 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  33.33 
 
 
464 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  26.32 
 
 
165 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.48 
 
 
168 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  37.29 
 
 
427 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  39.13 
 
 
194 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  34.09 
 
 
171 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  42.86 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  38.46 
 
 
133 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  28.16 
 
 
177 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1316  HNH nuclease  33.33 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.828783  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2057  HNH nuclease  33.33 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270784  normal  0.012989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  21.88 
 
 
182 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2755  HNH nuclease  33.33 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  21.88 
 
 
182 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  34.09 
 
 
173 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2827  HNH nuclease  33.33 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  21.88 
 
 
183 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  35.29 
 
 
165 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>