60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0082 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  100 
 
 		 372 aa  773    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  47.15 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  29.93 
 
 		 571 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  29.48 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  28.8 
 
 		 543 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  27.94 
 
 		 463 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  27.17 
 
 		 453 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  28.32 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  28.32 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  28.32 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  28.32 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  27.95 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  28.62 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  36.76 
 
 		 1223 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  28.51 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.19 
 
 		 1152 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  24.24 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  24.2 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  23.68 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  24.1 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  24.91 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  26.27 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  24.62 
 
 		 691 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  24.68 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  26.73 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  25.81 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  25 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  25.96 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  23.61 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  24.7 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  24.7 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  25 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  27.45 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  23.45 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  24.73 
 
 		 2690 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  27.05 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  23.27 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  24.86 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  24.51 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  24.79 
 
 		 477 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  22.27 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  23.95 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 1140 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  28.18 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  25.61 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  28.18 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  28.18 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 1140 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  28.18 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  25.29 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  26.56 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  23.44 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  30.83 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  25.58 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  25.58 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  25.58 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>