More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0030 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  50.08 
 
 		 885 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  50.39 
 
 		 882 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  43.66 
 
 		 751 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  52.27 
 
 		 888 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  55.92 
 
 		 642 aa  753    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  100 
 
 		 640 aa  1322    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  51.32 
 
 		 880 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  42.57 
 
 		 646 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  43.34 
 
 		 646 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  29.21 
 
 		 647 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.57 
 
 		 647 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  28.7 
 
 		 647 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  30.6 
 
 		 647 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.44 
 
 		 647 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  28.86 
 
 		 647 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  28.86 
 
 		 647 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.62 
 
 		 647 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  29.14 
 
 		 647 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.01 
 
 		 647 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  29.13 
 
 		 639 aa  256  9e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  28.99 
 
 		 639 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  28.03 
 
 		 689 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  29.66 
 
 		 680 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  29.37 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.61 
 
 		 692 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  28.09 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  27.53 
 
 		 693 aa  243  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  27.84 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  28.68 
 
 		 699 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  28.68 
 
 		 699 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  28.53 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.79 
 
 		 691 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  28.11 
 
 		 691 aa  240  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  27.83 
 
 		 697 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  29.05 
 
 		 691 aa  239  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  28.17 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  28.38 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.65 
 
 		 703 aa  238  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  27.5 
 
 		 694 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  26.84 
 
 		 692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  28.05 
 
 		 697 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.71 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  27.37 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  27.15 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.5 
 
 		 692 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.22 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.71 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  27.3 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  27.3 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.59 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  27.3 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  27.96 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  28.68 
 
 		 691 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  27.15 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  28.57 
 
 		 693 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  28.32 
 
 		 698 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  27.45 
 
 		 692 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  27.15 
 
 		 692 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  27.15 
 
 		 692 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  28.05 
 
 		 697 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  27.3 
 
 		 692 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.53 
 
 		 692 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  28.05 
 
 		 697 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  27.15 
 
 		 692 aa  234  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  27.62 
 
 		 693 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  27.54 
 
 		 694 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  27.62 
 
 		 693 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.23 
 
 		 691 aa  233  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  28.14 
 
 		 691 aa  232  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  26.52 
 
 		 704 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  26.28 
 
 		 693 aa  233  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  28.7 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  26.96 
 
 		 694 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  28.7 
 
 		 691 aa  230  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  28.7 
 
 		 691 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  28.7 
 
 		 691 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  27.59 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  28.59 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  26.35 
 
 		 699 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.17 
 
 		 697 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  28.98 
 
 		 696 aa  228  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  27.42 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  27.17 
 
 		 698 aa  228  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  28.12 
 
 		 697 aa  228  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  26.2 
 
 		 699 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  26.91 
 
 		 697 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  27.79 
 
 		 691 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  26.87 
 
 		 689 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  26.65 
 
 		 690 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.32 
 
 		 697 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  26.51 
 
 		 704 aa  227  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  27.25 
 
 		 701 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  26.58 
 
 		 701 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  27.25 
 
 		 701 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  27.25 
 
 		 701 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  27.53 
 
 		 691 aa  226  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  27.68 
 
 		 698 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  27.44 
 
 		 657 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>