More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0012 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 154 aa  306  8e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  56 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  55.63 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  48.7 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 148 aa  136  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2140  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  46.41 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.09 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  42.52 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  37.14 
 
 		 191 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  35.97 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  30.46 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  33.75 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  36.69 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  32 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.67 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  32 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  33.55 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  31.08 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  31.54 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  31.33 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  33.77 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  31.54 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  31.29 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>