More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0008 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 172 aa  347  3e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  52.79 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  53.93 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  51.56 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  53.37 
 
 		 173 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  53.37 
 
 		 173 aa  181  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  53.37 
 
 		 173 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  53.37 
 
 		 173 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  55.06 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  55.17 
 
 		 164 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  53.67 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  54.8 
 
 		 169 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  53.11 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  53.11 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  52.91 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  52.33 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  63.16 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  51.98 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  52.84 
 
 		 163 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  49.42 
 
 		 138 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  48.07 
 
 		 169 aa  160  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  46.51 
 
 		 138 aa  153  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  47.4 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  47.4 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  43.6 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  43.02 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  60.95 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  42.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  53.7 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 112 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 112 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 112 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 		 111 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  57.28 
 
 		 114 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 		 112 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 111 aa  131  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  51.89 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  51.35 
 
 		 121 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  42.04 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  53.4 
 
 		 150 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  38.73 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  38.95 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  45.24 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 136 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 133 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  38.73 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  45.22 
 
 		 131 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  37.21 
 
 		 148 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  49.53 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 139 aa  104  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  48.54 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.26 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  35.06 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  40.58 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  42.22 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  42.22 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  42.2 
 
 		 114 aa  99  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  42.2 
 
 		 114 aa  99  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  37.85 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  39.84 
 
 		 129 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.69 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  34.67 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 125 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 125 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 134 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 142 aa  91.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  48.98 
 
 		 140 aa  90.9  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  32.95 
 
 		 151 aa  90.9  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  37.72 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  36.29 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  32.77 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  34.72 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  32.37 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  37.3 
 
 		 143 aa  87.8  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>