More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0007 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  56.38 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  57.89 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  54.35 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  54.26 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  52.58 
 
 		 98 aa  116  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  53.19 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  51.65 
 
 		 96 aa  103  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  47.83 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  47.83 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  50.55 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  47.87 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  49.45 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  49.45 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  44.09 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.33 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  40 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  37.78 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  35.79 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  32.26 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>