More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t1834 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0164  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.405268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1707  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0020  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  95.89 
 
 
78 bp  121  2e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1464  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  95.89 
 
 
78 bp  121  2e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  95.89 
 
 
78 bp  121  2e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0518  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0461  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0053  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0040  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1372  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0654  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  115  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.08101e-11  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0024  tRNA-Ala  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00249338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.93148e-13  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0048  tRNA-Ala  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00554369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0079  tRNA-Ala  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20959e-13  unclonable  5.3075e-08 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  98.28 
 
 
76 bp  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  98.28 
 
 
76 bp  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  98.28 
 
 
76 bp  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  98.28 
 
 
76 bp  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  98.28 
 
 
76 bp  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.40506e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0004  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0012  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00270892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0038  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0052  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0059  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0065  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4325  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00976587  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0057  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0051  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0057  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0063  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0065  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195359  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4354  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4349  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271842  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0050  tRNA-Ala  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  98.21 
 
 
76 bp  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0053  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0417957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0008  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000503883  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  2.72915e-06 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  94.03 
 
 
76 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.90105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  94.03 
 
 
76 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0096  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493226 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  94.03 
 
 
76 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0004  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.14056e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0015  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0091  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87028e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0032  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244606  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0010  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081559  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0065  tRNA-Ala  94.03 
 
 
76 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0054  tRNA-Ala  94.03 
 
 
76 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0015  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143157  hitchhiker  0.00508793 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  94.03 
 
 
76 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.67693e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0003  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>