56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0235 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_t1925  tRNA-Tyr  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0235  tRNA-Tyr  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00420239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0072  tRNA-Tyr  92.42 
 
 
83 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0015  tRNA-Tyr  90.91 
 
 
83 bp  83.8  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000359756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  90.74 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000135792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  90.74 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.875932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  90.74 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0637  tRNA-Tyr  90.74 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000210414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0090  tRNA-Tyr  90.74 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2567  tRNA-Tyr  90.74 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1846  tRNA-Tyr  85.88 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0608  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0037  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000436078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0082  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0094  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000196241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0086  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00209074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0098  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0192  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0854  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000540408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5654  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000770795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5714  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5726  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000809965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4577  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4769  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  6.00721e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5144  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379395  normal  0.810906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0171  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0235528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0533  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30142e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0779  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74653e-30 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0044  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
81 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5651  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000725819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5679  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000538647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5688  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000511712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000316602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00144807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000630573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000017627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0044  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0075  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0075  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0037  tRNA-Tyr  90.48 
 
 
84 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  87.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0100  tRNA-Tyr  87.5 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna3  tRNA-Gln  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491814  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0055  tRNA-Gln  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000526045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0055  tRNA-Gln  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00371124  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0304  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0020  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000533123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0012  tRNA-Arg  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251285  normal  0.0396852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>