258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_r0022 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  89.89 
 
 
121 bp  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  89.89 
 
 
121 bp  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  89.89 
 
 
119 bp  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  89.89 
 
 
120 bp  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0050  5S ribosomal RNA  88.76 
 
 
120 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0026  5S ribosomal RNA  88.76 
 
 
120 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr03  5S ribosomal RNA  97.73 
 
 
103 bp  79.8  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr06  5S ribosomal RNA  97.73 
 
 
76 bp  79.8  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0061  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0012  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00424796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0073  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0064  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0144  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000122827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0076  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5740  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
111 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5752  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5758  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
111 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
111 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0092  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000371886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-10  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000146718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-11  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
109 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000314078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-2  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-3  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
119 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
114 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
118 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SJ  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SK  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000354497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0070  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0067  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0070  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0067  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
115 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0005  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0017  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00169127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0012  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0056  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000667986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0032  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0299918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0029  5S ribosomal RNA  91.38 
 
 
116 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>