84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2064 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  59.48 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  52.1 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  52.17 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  52.83 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  49.14 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  52.83 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  52.83 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  52.83 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  52.83 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  52.83 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  52.83 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  51.89 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  49.09 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  45.95 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  42.48 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  45.63 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  43.59 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  40.35 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  40.35 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  38.6 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  37 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  32.11 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  36.26 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.55 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  31.07 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  30.7 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.04 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  31.58 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  31.58 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  30.56 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  31.58 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.63 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  35.87 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  24.53 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  26.55 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  28.42 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  32.94 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  30.51 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  29.82 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  32.48 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  31.11 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  31.11 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  31.76 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  32.04 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  39.76 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  34.94 
 
 		 119 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  30.65 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  29.63 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  29.63 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  31.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  29.63 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  34.94 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  32.41 
 
 		 147 aa  40  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  30.3 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  34.72 
 
 		 119 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>