254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2026 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 102 aa  209  7e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  44 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  37 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  34.65 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  34.65 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  34.95 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  34.65 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  38.14 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  39.22 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  39.22 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  36.73 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  38.3 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  32 
 
 		 110 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  37.25 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  31.37 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  32.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  31 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  31 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2382  PadR-like family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.886804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2577  hypothetical protein  37.23 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000426616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2585  hypothetical protein  36.17 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46974e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2314  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2351  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000125043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  37.11 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  33 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  35.11 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2627  hypothetical protein  36.26 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000391124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2398  hypothetical protein  35.11 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0399809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2573  hypothetical protein  35.11 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  35.64 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.57 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  38.54 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>