52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2018 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2018  transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000120097  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  32.62 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  32.48 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  22.94 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  19.47 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  22.02 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  21.1 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  27.36 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  28.33 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  25.84 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  28.07 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 140 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  29.66 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.91 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 146 aa  40.8  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.38 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  21.59 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 140 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>