201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1978 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  358  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  41.03 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  41.03 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  41.03 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  41.03 
 
 		 92 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  46.55 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  27.05 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.38 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  45.9 
 
 		 293 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  36.46 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  27.61 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 361 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  35.94 
 
 		 459 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  32.18 
 
 		 256 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 362 aa  51.6  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  35.11 
 
 		 366 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 118 aa  50.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 395 aa  50.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  40.68 
 
 		 436 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 380 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  30.16 
 
 		 327 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1184  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 374 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  40.68 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 75 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 296 aa  48.5  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 99 aa  48.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  36.67 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  28.75 
 
 		 338 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 276 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 370 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 66 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0149  molybdate-binding domain-containing protein  24.76 
 
 		 349 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0290887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 334 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.31 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 358 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  31.67 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  30.56 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>