More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1970 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  73.68 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  62.37 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  61.96 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  56.38 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  52.69 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  53.76 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  53.76 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  53.76 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  53.76 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  52.69 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  49.46 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  49.46 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  49.46 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  35.16 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  30.53 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.18 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  30.43 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  30 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  28.12 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  27.84 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>