More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1962 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  61.16 
 
 		 243 aa  321  8e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  60.33 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  31.56 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.14 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.14 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.22 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.14 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.14 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.14 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 235 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 195 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.53 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 195 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  31.93 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.95 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.46 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.46 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  26.46 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.51 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  26.37 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  26.01 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  26.01 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.85 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0886  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.11 
 
 		 238 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  25.56 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>