289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1945 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  323  5e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  73.58 
 
 
159 aa  249  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  67.92 
 
 
159 aa  229  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  206  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  196  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  60.38 
 
 
159 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 
159 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  55.35 
 
 
160 aa  191  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  55.35 
 
 
159 aa  191  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  190  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  189  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
167 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
167 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
177 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  184  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  183  1e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 
159 aa  182  1e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 
159 aa  182  1e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  181  5e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 
159 aa  180  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  176  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  173  1e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
160 aa  172  2e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  167  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  165  3e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  165  3e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  162  2e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  46.2 
 
 
159 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  157  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  47.8 
 
 
165 aa  154  5e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  45.28 
 
 
159 aa  154  5e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  45.91 
 
 
159 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  47.17 
 
 
160 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  47.17 
 
 
156 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  46.25 
 
 
160 aa  148  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  43.4 
 
 
160 aa  146  1e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  40.88 
 
 
159 aa  145  2e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  48.32 
 
 
155 aa  144  7e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.21376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  141  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  43.83 
 
 
154 aa  130  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  127  4e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  40.25 
 
 
158 aa  125  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.11 
 
 
159 aa  124  4e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  42.41 
 
 
156 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 
157 aa  119  1e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  40.25 
 
 
150 aa  118  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 
157 aa  116  1e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.74 
 
 
153 aa  114  4e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  43.4 
 
 
154 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 
157 aa  113  1e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.99 
 
 
159 aa  112  2e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
166 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 
155 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.20768e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
156 aa  109  1e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  32.72 
 
 
156 aa  109  1e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  38.99 
 
 
157 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
162 aa  108  4e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.59 
 
 
156 aa  108  4e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  35.67 
 
 
155 aa  107  7e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  38.99 
 
 
148 aa  107  7e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  107  8e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
155 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
153 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
156 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.37083e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  36.48 
 
 
155 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
162 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  34.59 
 
 
153 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  32.72 
 
 
155 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  39.75 
 
 
155 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  32.08 
 
 
156 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  35.22 
 
 
153 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
156 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
156 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.35521e-05  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
156 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56643e-10  hitchhiker  5.16486e-10 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
156 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.16859e-08  decreased coverage  2.22893e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
156 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.08815e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
155 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
156 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  35.22 
 
 
156 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>