More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1941 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  100 
 
 
370 aa  759  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  51.34 
 
 
371 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  44.77 
 
 
375 aa  315  9e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.64 
 
 
384 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  39.12 
 
 
367 aa  259  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  40.22 
 
 
367 aa  259  7e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  40.43 
 
 
389 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  37.17 
 
 
376 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  38.98 
 
 
387 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  39.62 
 
 
389 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.35 
 
 
389 aa  254  1e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  39.35 
 
 
389 aa  255  1e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  39.35 
 
 
389 aa  255  1e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.35 
 
 
389 aa  254  1e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.35 
 
 
389 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  39.08 
 
 
389 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.08 
 
 
389 aa  253  4e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  35.71 
 
 
373 aa  252  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  39.08 
 
 
389 aa  252  8e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  39.35 
 
 
389 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  37.23 
 
 
366 aa  240  3e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  35.64 
 
 
386 aa  225  8e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  34.97 
 
 
373 aa  213  4e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  34.74 
 
 
391 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.74 
 
 
391 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.3 
 
 
391 aa  201  2e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.77 
 
 
391 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  35.25 
 
 
379 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.77 
 
 
391 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.21 
 
 
391 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  34.47 
 
 
391 aa  200  4e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.04 
 
 
391 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.77 
 
 
391 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.2 
 
 
392 aa  197  2e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.53 
 
 
373 aa  197  2e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.33 
 
 
386 aa  197  2e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.6 
 
 
386 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  32.71 
 
 
388 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.04 
 
 
390 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  34.4 
 
 
851 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  30.87 
 
 
380 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  32.11 
 
 
379 aa  190  3e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  35.54 
 
 
408 aa  190  3e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.13 
 
 
377 aa  189  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  32.89 
 
 
382 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  33.59 
 
 
390 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  32.89 
 
 
382 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.51 
 
 
398 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.82 
 
 
373 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.99 
 
 
373 aa  185  1e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  33.61 
 
 
356 aa  184  2e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  34.05 
 
 
371 aa  184  2e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  32.44 
 
 
391 aa  183  4e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  34.59 
 
 
369 aa  182  9e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  31.37 
 
 
373 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  30.73 
 
 
382 aa  179  6e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  32.7 
 
 
389 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  32.35 
 
 
390 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.28 
 
 
389 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  34.85 
 
 
406 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.2 
 
 
403 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  32.89 
 
 
441 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.38 
 
 
403 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.03 
 
 
376 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  33.95 
 
 
380 aa  175  9e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  32.17 
 
 
421 aa  174  2e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  31.85 
 
 
388 aa  174  3e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  32.45 
 
 
398 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  34.77 
 
 
380 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  31.18 
 
 
373 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.29 
 
 
411 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  32.08 
 
 
375 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  33.25 
 
 
387 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  32.1 
 
 
370 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  30.4 
 
 
378 aa  165  1e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  32.2 
 
 
382 aa  165  2e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  32.7 
 
 
364 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  31.55 
 
 
395 aa  163  4e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  31.79 
 
 
376 aa  163  5e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  31.66 
 
 
403 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  30.25 
 
 
395 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  30.05 
 
 
395 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  31.38 
 
 
434 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  32.81 
 
 
379 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  30.05 
 
 
370 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  31.75 
 
 
390 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  29.07 
 
 
373 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  30.05 
 
 
395 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  33.33 
 
 
364 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  33.6 
 
 
368 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  29.55 
 
 
402 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  33.16 
 
 
382 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  31.96 
 
 
358 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  31.5 
 
 
384 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  31.03 
 
 
399 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.38 
 
 
433 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  31.27 
 
 
365 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  31.78 
 
 
358 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  31.78 
 
 
358 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  8.14721e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  31.78 
 
 
358 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>