More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1855 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  100 
 
 		 443 aa  873    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  50.34 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  46.5 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  46.5 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  46.5 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  46.38 
 
 		 437 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  46.71 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  46.5 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  46.5 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  46.5 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  46.38 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  46.7 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  43.08 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  44.24 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 		 440 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 		 440 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  34.82 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  33.11 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  30.64 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.92 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  30.84 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  28.96 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  28.98 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  30.11 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  29.68 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.83 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.04 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 484 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  31.25 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.04 
 
 		 462 aa  133  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  28.92 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  28.92 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  28.92 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  25.49 
 
 		 580 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  28.92 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  28.92 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  29.23 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.19 
 
 		 609 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 475 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 770 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  23.81 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  24.8 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.91 
 
 		 753 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 773 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 447 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 786 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 716 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 495 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 745 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.28 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  29.88 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.48 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  27.64 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.48 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.52 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.35 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.35 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.01 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.52 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.74 
 
 		 467 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.71 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.52 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.52 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 820 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>