68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1752 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  48.37 
 
 
1527 aa  1335    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  55.22 
 
 
2821 aa  1566    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  64.84 
 
 
1475 aa  1967    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  100 
 
 
1514 aa  3063    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  38.21 
 
 
1363 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  27.55 
 
 
1557 aa  93.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  27.24 
 
 
651 aa  89.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  34.13 
 
 
502 aa  88.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  34.29 
 
 
613 aa  87  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  29.06 
 
 
757 aa  85.1  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.39 
 
 
762 aa  82  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  34.95 
 
 
478 aa  80.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  26.58 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  32.34 
 
 
807 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  29.35 
 
 
602 aa  75.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  48.48 
 
 
538 aa  73.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.64 
 
 
811 aa  71.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 
890 aa  70.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  29.96 
 
 
592 aa  69.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  29.13 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  30.73 
 
 
817 aa  68.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  30.87 
 
 
342 aa  66.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  29.55 
 
 
2495 aa  65.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  24.46 
 
 
750 aa  63.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  27.42 
 
 
430 aa  63.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  25.35 
 
 
753 aa  63.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  30.17 
 
 
512 aa  62.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  30.32 
 
 
532 aa  61.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  30.68 
 
 
184 aa  60.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  26.63 
 
 
550 aa  55.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  29.17 
 
 
331 aa  55.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  23.35 
 
 
454 aa  55.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  26.69 
 
 
737 aa  52.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  23.68 
 
 
573 aa  52.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  23.91 
 
 
420 aa  52.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  38.32 
 
 
549 aa  50.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
513 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
513 aa  50.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  30.08 
 
 
302 aa  50.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
513 aa  50.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  23.15 
 
 
513 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  26.32 
 
 
696 aa  49.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  25.39 
 
 
552 aa  49.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  28.41 
 
 
316 aa  49.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  33.59 
 
 
440 aa  48.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  25.58 
 
 
1131 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  25.58 
 
 
1131 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  25.46 
 
 
621 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  22.84 
 
 
513 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  21.05 
 
 
529 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  22.53 
 
 
513 aa  47.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.58 
 
 
839 aa  47.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  30.66 
 
 
1009 aa  47.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  36.44 
 
 
507 aa  47.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  36.36 
 
 
532 aa  47  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  28.03 
 
 
578 aa  47  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  23.81 
 
 
697 aa  47  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  21.6 
 
 
513 aa  47  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  32.38 
 
 
495 aa  46.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  34.38 
 
 
203 aa  46.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  41.07 
 
 
483 aa  46.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  32.38 
 
 
495 aa  46.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  32.38 
 
 
495 aa  46.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  32.38 
 
 
495 aa  46.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  32.38 
 
 
495 aa  46.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  32.38 
 
 
495 aa  45.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  32.38 
 
 
495 aa  45.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2049  hypothetical protein  25 
 
 
556 aa  45.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.383654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>