95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1750 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  42.35 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 		 382 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  33.71 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  40.35 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 255 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  40.91 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  28.99 
 
 		 138 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 71 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 183 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  30.88 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  28.77 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  28.77 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 239 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 371 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  40  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  26.13 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 189 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 187 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.71 
 
 		 401 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.79 
 
 		 481 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 188 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 90 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>