More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1710 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1228  RNA-binding protein  44.88 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0834946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  44.63 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  40.8 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  39.17 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  37.98 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  40 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  39.17 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  39.17 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  37.93 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  37.61 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  36.22 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  37.82 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  35.2 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.13 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  46.05 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.13 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  46.05 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  34.13 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  46.05 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  31.97 
 
 		 492 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.14 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.48 
 
 		 733 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 584 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 584 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  41.77 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  40.54 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  40.54 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  41.03 
 
 		 557 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.73 
 
 		 503 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  39.22 
 
 		 586 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  37.84 
 
 		 763 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  42.11 
 
 		 577 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  40.79 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 746 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 747 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  39.47 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  37.97 
 
 		 584 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  40.54 
 
 		 515 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  31.75 
 
 		 488 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  42.11 
 
 		 587 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  39.74 
 
 		 574 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.73 
 
 		 514 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 755 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  30.89 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  31.75 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  31.15 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 777 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  31.15 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  31.15 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  39.47 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  31.15 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  39.74 
 
 		 604 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.18 
 
 		 732 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  39.19 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  38.16 
 
 		 586 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  39.19 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1986  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.58 
 
 		 708 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00363303  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 491 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  36.19 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  39.19 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3570  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  30.89 
 
 		 491 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  30.17 
 
 		 488 aa  57.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  39.19 
 
 		 493 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  37.66 
 
 		 588 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  28.8 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  30.16 
 
 		 496 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  35.9 
 
 		 598 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.67 
 
 		 411 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  39.19 
 
 		 493 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  30.33 
 
 		 481 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  39.19 
 
 		 480 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.63 
 
 		 790 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  37.84 
 
 		 493 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  37.66 
 
 		 589 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  37.66 
 
 		 592 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  39.19 
 
 		 487 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  37.84 
 
 		 495 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.21 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>