37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1687 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
111 aa  227  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
115 aa  57.4  7e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 
115 aa  52.4  2e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
115 aa  52  3e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 
140 aa  50.8  5e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.18472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 
111 aa  50.1  1e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 
110 aa  48.9  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 
110 aa  48.9  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 
141 aa  48.5  3e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
127 aa  47.8  6e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  30.84 
 
 
117 aa  47.4  7e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
100 aa  47.4  7e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
137 aa  47  8e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  30.14 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  30.14 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  31.03 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
281 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  30.99 
 
 
301 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.55 
 
 
436 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
268 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.35 
 
 
374 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  32.35 
 
 
374 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.34 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.34 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  34.48 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.48 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>