More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1618 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  66.31 
 
 
187 aa  265  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  62.84 
 
 
185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  61.41 
 
 
185 aa  240  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  61.41 
 
 
185 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  62.3 
 
 
185 aa  234  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  62.3 
 
 
185 aa  234  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  59.24 
 
 
185 aa  227  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  59.24 
 
 
185 aa  227  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  58.7 
 
 
185 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  58.7 
 
 
185 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  58.7 
 
 
185 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  58.7 
 
 
185 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  58.15 
 
 
185 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  58.7 
 
 
185 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  58.7 
 
 
185 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  57.07 
 
 
185 aa  224  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  57.07 
 
 
185 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  54.35 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  52.72 
 
 
185 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  51.91 
 
 
185 aa  197  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  50.82 
 
 
185 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  50.82 
 
 
185 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  49.19 
 
 
186 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  49.46 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  50.82 
 
 
185 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  46.45 
 
 
185 aa  187  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  50.27 
 
 
185 aa  184  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  47.59 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  47.54 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  51.11 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  46.96 
 
 
190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  46.45 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  46.74 
 
 
186 aa  181  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  48.07 
 
 
185 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  48.63 
 
 
185 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  48.04 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  48.07 
 
 
187 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.37 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  48.09 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  48.33 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  46.45 
 
 
186 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  46.45 
 
 
186 aa  177  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  46.45 
 
 
186 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  48.09 
 
 
185 aa  177  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  44.81 
 
 
188 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  44.02 
 
 
186 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  52.22 
 
 
186 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  46.45 
 
 
186 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  46.45 
 
 
185 aa  175  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  47.51 
 
 
185 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  46.74 
 
 
185 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  174  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  48.89 
 
 
185 aa  174  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  46.96 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  49.45 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  44.44 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  46.67 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  45.9 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  46.96 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  46.41 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  46.7 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  47.51 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  45.41 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  45.36 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  47.22 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  45.65 
 
 
185 aa  171  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  44.81 
 
 
187 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1715  elongation factor P  47.57 
 
 
186 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  45.36 
 
 
186 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  44.2 
 
 
204 aa  168  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  44.81 
 
 
187 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  45.16 
 
 
186 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  45.16 
 
 
186 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  45.05 
 
 
189 aa  167  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  44.81 
 
 
187 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  46.67 
 
 
187 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  45.3 
 
 
187 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  45.36 
 
 
192 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  44.32 
 
 
186 aa  166  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  44.69 
 
 
187 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  45.11 
 
 
185 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  45.11 
 
 
185 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  44.13 
 
 
185 aa  165  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  45.56 
 
 
187 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  44.13 
 
 
187 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  44.69 
 
 
187 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  42.93 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  45.56 
 
 
187 aa  164  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  44.32 
 
 
187 aa  164  8e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  43.41 
 
 
186 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  44.69 
 
 
187 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  44.69 
 
 
187 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  44.69 
 
 
187 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  44.44 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  44.51 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  42.54 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>