More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1586 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  100 
 
 		 361 aa  743    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  41.88 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  42.54 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  42.27 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  43.55 
 
 		 374 aa  275  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.57 
 
 		 380 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  44.06 
 
 		 369 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  42.2 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  41.24 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  41.91 
 
 		 371 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.52 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  42 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  40.06 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  39.27 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  39.55 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  39.55 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  42.07 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  41.12 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  40.63 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  41.5 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  40.92 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  41.57 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  40.75 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  40.29 
 
 		 359 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 		 430 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  39.14 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  40.92 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  40.34 
 
 		 369 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  40.68 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.14 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  39.2 
 
 		 357 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  40.4 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  37.9 
 
 		 357 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  39.6 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  35.39 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 375 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  38.57 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  40.99 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 410 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 373 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  41.2 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.9 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  37.22 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  36.84 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  44.49 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  38.84 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  37.89 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  37.89 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  38.04 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  38.01 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  39.4 
 
 		 357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  44.05 
 
 		 354 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  44.66 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  38.27 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  37.43 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  39.4 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  44.27 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  36.68 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  44.27 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  38.15 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  36.73 
 
 		 361 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  34.83 
 
 		 466 aa  212  9e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 408 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  37.72 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  39.4 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  37.03 
 
 		 429 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  36.89 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  37.18 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  40.07 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  36.61 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  37.86 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  35.2 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  42.15 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.8 
 
 		 385 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.83 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  43.87 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  36.99 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  36.1 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  38.74 
 
 		 362 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  37.57 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  37.57 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  37.57 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  39.35 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>