More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1565 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  65.44 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  45.98 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  46.82 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  46.12 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  46.08 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  42.04 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.67 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  43.1 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  43.1 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  44.14 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  44.14 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  43.1 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  44.14 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  44.14 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  43.72 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  43.06 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  42.17 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44.65 
 
 		 235 aa  175  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.87 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  42.59 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.05 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  40.55 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  37.83 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  36.65 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  36.65 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.13 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  39.37 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.73 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  38.92 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.74 
 
 		 377 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  36.28 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  36.28 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  39.81 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  36.82 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.95 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.61 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.1 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.5 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.29 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  35.53 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  37.16 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  35.45 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.81 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  36.7 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.05 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.24 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  36.7 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.41 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  34.07 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  35.62 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  37.44 
 
 		 383 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.97 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  37.44 
 
 		 383 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.49 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  36.32 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  37.21 
 
 		 279 aa  131  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  38.97 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  38.35 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  35.4 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37.5 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  36.17 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  33.63 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.92 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  36.65 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  36.97 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  36.8 
 
 		 228 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  35.98 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  37.22 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  37.9 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  36.36 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  36.15 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  33.03 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  36.92 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  34.89 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  33.63 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  35.19 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  34.93 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35.11 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  35 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  37.72 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  35.19 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  36 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  32.63 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  36.49 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  36.49 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  34.27 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.81 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  34.88 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  34.23 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  34.95 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  34.08 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  34.7 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  37.61 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  35 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>