More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1537 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 370 aa  748    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0754  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1455  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  29.37 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 386 aa  92.8  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  26.27 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.9 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  22.64 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  32.32 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  24.86 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  30.93 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 542 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  34.74 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  31.58 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  22.17 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.71 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4523  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.027207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  28.57 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.69 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0064  helix-turn-helix, AraC type  30.84 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.585972  normal  0.173321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.71 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.69 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0360  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.69 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  30.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.69 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.87 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  30.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  30.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  30.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  30.53 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.01 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  34.34 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>