More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1522 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  100 
 
 
431 aa  859  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  55.58 
 
 
436 aa  470  1e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.3301e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  52.69 
 
 
439 aa  466  1e-130  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  54.55 
 
 
449 aa  447  1e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.24107e-11  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  53.83 
 
 
427 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  54.42 
 
 
427 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  51.79 
 
 
427 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  47.2 
 
 
428 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  47.2 
 
 
428 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  7.07375e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  46.98 
 
 
427 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  46.03 
 
 
425 aa  352  6e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  46.03 
 
 
425 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.16057e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  45.79 
 
 
425 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  45.79 
 
 
425 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.55995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  45.79 
 
 
425 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  45.79 
 
 
425 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  45.79 
 
 
425 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  45.79 
 
 
425 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  45.56 
 
 
425 aa  345  9e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  45.56 
 
 
425 aa  345  9e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  42.55 
 
 
433 aa  339  6e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  5.17183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  42.55 
 
 
433 aa  339  6e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  41.37 
 
 
433 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  43.87 
 
 
446 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.28546e-07  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  41.34 
 
 
435 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.72878e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  41.94 
 
 
446 aa  305  8e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  38.85 
 
 
435 aa  302  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.27269e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  38.77 
 
 
428 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  38.69 
 
 
432 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  39.86 
 
 
428 aa  287  3e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  40.59 
 
 
426 aa  285  1e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  38.7 
 
 
429 aa  284  2e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  39.48 
 
 
438 aa  279  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  37.88 
 
 
428 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  37.3 
 
 
451 aa  273  4e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  38.83 
 
 
435 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  36.63 
 
 
438 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.82138e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.13 
 
 
428 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  42.13 
 
 
428 aa  255  1e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  34.68 
 
 
438 aa  254  2e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  37.23 
 
 
435 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.92 
 
 
488 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  36.95 
 
 
435 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  37.02 
 
 
433 aa  226  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  35.4 
 
 
433 aa  215  1e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  33.33 
 
 
430 aa  214  3e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.78 
 
 
434 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  31.65 
 
 
442 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.98 
 
 
431 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.09 
 
 
478 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.89 
 
 
448 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  30.21 
 
 
447 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  31.65 
 
 
455 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  31.65 
 
 
455 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.5 
 
 
500 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  34.73 
 
 
434 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.02256e-07  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  34.73 
 
 
434 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.77099e-08  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.33 
 
 
424 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  34.73 
 
 
434 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.1517e-06  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  34.73 
 
 
432 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  33.16 
 
 
434 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.15435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.59 
 
 
436 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  34.21 
 
 
434 aa  185  1e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.59254e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  34.21 
 
 
434 aa  185  1e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.72139e-08  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  34.21 
 
 
434 aa  185  1e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.36756e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  34.21 
 
 
434 aa  186  1e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.81502e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.21 
 
 
434 aa  184  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.31467e-06  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  31.84 
 
 
500 aa  184  2e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  29.95 
 
 
426 aa  184  3e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  29.5 
 
 
447 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  34.46 
 
 
434 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  30.13 
 
 
448 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  30.47 
 
 
435 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.85 
 
 
434 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.48222e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  34.2 
 
 
434 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.1134e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  33.25 
 
 
432 aa  181  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.26608e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  33.25 
 
 
432 aa  181  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.5414e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  33.25 
 
 
432 aa  181  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.82354e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.88 
 
 
479 aa  181  3e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  33.42 
 
 
434 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.60382e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  34.13 
 
 
443 aa  180  5e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  33.86 
 
 
437 aa  180  5e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.98 
 
 
432 aa  179  6e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.41 
 
 
434 aa  179  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.53037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.41 
 
 
434 aa  179  6e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.41 
 
 
434 aa  179  6e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.66473e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.98 
 
 
432 aa  179  6e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.26 
 
 
435 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  33.88 
 
 
434 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.23079e-06  hitchhiker  4.34188e-06 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  30.85 
 
 
432 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  30.79 
 
 
428 aa  179  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.88 
 
 
444 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.66404e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30.64 
 
 
468 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.07 
 
 
436 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  33.86 
 
 
437 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.77 
 
 
433 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.77902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  32.98 
 
 
432 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.62738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  32.98 
 
 
432 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.93083e-05  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  32.98 
 
 
432 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.19065e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  32.98 
 
 
432 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>