More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1515 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  44.9 
 
 
802 aa  702    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  47.39 
 
 
801 aa  756    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  47.72 
 
 
796 aa  758    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  47.51 
 
 
801 aa  759    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  47.39 
 
 
801 aa  756    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  47.26 
 
 
801 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  47.26 
 
 
801 aa  753    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  48.15 
 
 
801 aa  739    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  44.6 
 
 
802 aa  685    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 
804 aa  780    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  47.39 
 
 
801 aa  756    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  46.86 
 
 
801 aa  749    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  47.39 
 
 
801 aa  759    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  44.6 
 
 
802 aa  685    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  54.84 
 
 
809 aa  892    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  46.89 
 
 
801 aa  751    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  47.26 
 
 
801 aa  759    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  47.26 
 
 
801 aa  754    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  48.26 
 
 
781 aa  755    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  51.37 
 
 
803 aa  849    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  48.83 
 
 
798 aa  784    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  100 
 
 
803 aa  1670    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  49.19 
 
 
798 aa  771    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.65 
 
 
745 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  45.68 
 
 
732 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  39.75 
 
 
732 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  39.46 
 
 
775 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  40.44 
 
 
754 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  37.01 
 
 
815 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  39.86 
 
 
828 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  37.05 
 
 
818 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  49.1 
 
 
758 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.49 
 
 
751 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  38.46 
 
 
746 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  38.96 
 
 
744 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  44.05 
 
 
731 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  43.88 
 
 
731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  40 
 
 
752 aa  515  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  45.9 
 
 
724 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  37.28 
 
 
815 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  44.76 
 
 
747 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  47.07 
 
 
752 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  44.79 
 
 
735 aa  498  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  35.99 
 
 
815 aa  497  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  36.14 
 
 
813 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  43.87 
 
 
738 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  36.09 
 
 
732 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  45.8 
 
 
749 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  36.16 
 
 
790 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  36.21 
 
 
812 aa  489  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  37.06 
 
 
815 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  35.88 
 
 
835 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  42.93 
 
 
730 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  44.2 
 
 
715 aa  482  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  36.79 
 
 
835 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  35.66 
 
 
843 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  37.55 
 
 
815 aa  482  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  35.31 
 
 
802 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  37.14 
 
 
805 aa  479  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  34.52 
 
 
811 aa  476  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  34.52 
 
 
848 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  35.72 
 
 
745 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  34.35 
 
 
815 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  36.02 
 
 
868 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  42.44 
 
 
786 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  36.15 
 
 
831 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  35.11 
 
 
812 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  34.15 
 
 
815 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  35.88 
 
 
866 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  41.69 
 
 
810 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  34.76 
 
 
738 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  43.87 
 
 
810 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  36.01 
 
 
810 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  35.71 
 
 
825 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  35.21 
 
 
836 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  43.53 
 
 
695 aa  460  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  45.56 
 
 
792 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.68 
 
 
661 aa  458  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  36.63 
 
 
829 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  33.92 
 
 
849 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.26 
 
 
815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  36.25 
 
 
821 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  35.68 
 
 
804 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  39.26 
 
 
768 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  33.68 
 
 
914 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  43.12 
 
 
858 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  44.42 
 
 
780 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  34.3 
 
 
832 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  34.21 
 
 
733 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  35.79 
 
 
736 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  43.14 
 
 
679 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  33.91 
 
 
824 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  41.28 
 
 
660 aa  433  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  44.63 
 
 
770 aa  436  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  42.43 
 
 
662 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  43.38 
 
 
806 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  44.42 
 
 
738 aa  435  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  33.97 
 
 
815 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  42.24 
 
 
662 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.46 
 
 
774 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>