More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1507 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 
104 aa  216  7e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  61.54 
 
 
104 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  64.71 
 
 
103 aa  144  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  59.62 
 
 
104 aa  144  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.29683e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54.37 
 
 
104 aa  132  1e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  58 
 
 
104 aa  129  1e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  56.86 
 
 
104 aa  129  2e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.24157e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  54 
 
 
104 aa  122  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  110  1e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.56705e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  47.62 
 
 
105 aa  109  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  49.51 
 
 
104 aa  108  2e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  46.6 
 
 
104 aa  106  9e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  46.6 
 
 
104 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  46.6 
 
 
104 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  42.72 
 
 
108 aa  103  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  45 
 
 
109 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  47.57 
 
 
104 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  51.02 
 
 
106 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  48.98 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  47.06 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  41 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  48.98 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  47.47 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.23 
 
 
107 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  47.96 
 
 
106 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.94 
 
 
108 aa  93.2  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47.96 
 
 
120 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  51.22 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  48.98 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  46.88 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  47.96 
 
 
108 aa  92  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  46.6 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  48.15 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  43.69 
 
 
106 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  46.94 
 
 
106 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.62152e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  42.27 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  44.66 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  42.27 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  45.54 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  44.21 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  41.75 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  46.53 
 
 
109 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  43.69 
 
 
106 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  44.55 
 
 
108 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.17679e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  45.1 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  48.19 
 
 
105 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.92 
 
 
106 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  45 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.65425e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  45 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  1.21318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  51.25 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  47.56 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.30614e-09  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  46.34 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.78 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  44.66 
 
 
259 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  43.14 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  41.75 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  46.46 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  46 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  42.31 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  46.32 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  42.72 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  41.75 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  42.72 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.90247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  43 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  44 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  42.42 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.25 
 
 
109 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  43.56 
 
 
111 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  43 
 
 
109 aa  87  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  45.12 
 
 
109 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.45924e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  46.81 
 
 
114 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  46.51 
 
 
108 aa  87  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  42 
 
 
108 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>