More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1481 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41.12 
 
 
1186 aa  844    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  34.68 
 
 
1204 aa  666    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  100 
 
 
1230 aa  2505    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  34.29 
 
 
1241 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  34.27 
 
 
1241 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  34.09 
 
 
1241 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  33.86 
 
 
1241 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  34.01 
 
 
1241 aa  632  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  34.09 
 
 
1241 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  34.17 
 
 
1241 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  34.01 
 
 
1242 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  34.26 
 
 
1244 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  34.5 
 
 
1241 aa  632  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  33.96 
 
 
1240 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  33.86 
 
 
1241 aa  629  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  34.26 
 
 
1242 aa  625  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  32.85 
 
 
1244 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  34.59 
 
 
1392 aa  556  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.97 
 
 
1251 aa  539  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.38 
 
 
1271 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  30.33 
 
 
1270 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  31.9 
 
 
1230 aa  512  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.02 
 
 
1203 aa  510  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.33 
 
 
1233 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  31.34 
 
 
1248 aa  505  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.07 
 
 
1236 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.86 
 
 
1217 aa  487  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  30.15 
 
 
1217 aa  479  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  30.15 
 
 
1217 aa  479  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  33.8 
 
 
1282 aa  469  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  30.79 
 
 
1218 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  29.71 
 
 
1207 aa  456  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  33.26 
 
 
1377 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  28.72 
 
 
1392 aa  446  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 
1121 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 
1240 aa  350  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.46 
 
 
1405 aa  233  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 
1173 aa  190  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 
1149 aa  188  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  24.74 
 
 
1226 aa  183  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.94 
 
 
1057 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.22 
 
 
1080 aa  166  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 
1185 aa  164  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 
1184 aa  158  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25.44 
 
 
1089 aa  153  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.29 
 
 
1197 aa  152  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  27.52 
 
 
1177 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
1147 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  26.13 
 
 
1187 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 
1061 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.24 
 
 
1262 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.96 
 
 
1251 aa  138  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 
1161 aa  137  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 
1074 aa  137  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 
1165 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 
1165 aa  135  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  24 
 
 
1124 aa  134  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 
1196 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27 
 
 
1061 aa  133  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 
1123 aa  133  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  26.54 
 
 
833 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  23.35 
 
 
1166 aa  133  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.96 
 
 
1115 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  23.33 
 
 
1125 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 
1095 aa  131  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 
1162 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 
1173 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  23.71 
 
 
1185 aa  129  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 
1121 aa  128  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 
1173 aa  127  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  23.79 
 
 
1157 aa  127  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.45 
 
 
1139 aa  125  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 
1187 aa  124  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.06 
 
 
1240 aa  124  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.56 
 
 
1203 aa  123  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  22.17 
 
 
1054 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 
1110 aa  122  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 
1182 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  26.8 
 
 
1183 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  22.57 
 
 
1140 aa  120  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 
1107 aa  119  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  26.52 
 
 
1155 aa  119  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  25 
 
 
1130 aa  118  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.4 
 
 
1119 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  25.36 
 
 
787 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  25.36 
 
 
787 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  25.36 
 
 
787 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  28.04 
 
 
1183 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.36 
 
 
787 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  24.82 
 
 
787 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  25.36 
 
 
787 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 
1120 aa  116  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  25.56 
 
 
1110 aa  116  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  26.18 
 
 
1182 aa  116  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.18 
 
 
787 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  25.18 
 
 
787 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.23 
 
 
1200 aa  115  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 
854 aa  115  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  23.7 
 
 
1117 aa  115  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 
1103 aa  114  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>