188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1361 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
49 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  3.86724e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1029  50S ribosomal protein L33  85.42 
 
 
54 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  7.70423e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 
49 aa  74.7  4e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 
49 aa  74.3  5e-13  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  2.17795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 
49 aa  71.2  4e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  6.89148e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  59.18 
 
 
49 aa  65.1  3e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 
49 aa  61.2  4e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
49 aa  57.4  7e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  8.27111e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  7.66493e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  55.8  2e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 
49 aa  55.5  2e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.60054e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
55 aa  52.4  2e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  46.94 
 
 
49 aa  51.6  4e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.37261e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  51.85 
 
 
60 aa  50.8  6e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
49 aa  50.4  7e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  3.60963e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  48.15 
 
 
60 aa  50.4  9e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
49 aa  50.4  9e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
56 aa  48.9  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
49 aa  48.9  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
49 aa  48.9  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  46.94 
 
 
49 aa  49.3  2e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
60 aa  48.9  2e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 
60 aa  48.9  2e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  48.98 
 
 
54 aa  49.3  2e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
54 aa  48.5  3e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
56 aa  48.9  3e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
52 aa  48.5  3e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
49 aa  48.5  3e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
52 aa  48.5  3e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  1.00015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  42.86 
 
 
49 aa  48.5  3e-05  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  51.02 
 
 
57 aa  48.5  3e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
52 aa  48.5  3e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 
52 aa  48.1  4e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  46.94 
 
 
55 aa  48.1  5e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
54 aa  47.8  5e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
49 aa  47.4  6e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
56 aa  47.4  7e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 
56 aa  47.4  7e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  55 
 
 
54 aa  47.4  7e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  67.74 
 
 
54 aa  47  8e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1484  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
48 aa  47  9e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.98588e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
49 aa  47  9e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  42.86 
 
 
55 aa  47  9e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
54 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  50 
 
 
61 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  48.15 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  44.9 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  58.82 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.11792e-08 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  42.86 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  44.9 
 
 
51 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  2.43211e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  43.75 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  40.82 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  58.82 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  2.85093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  45.83 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
51 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
49 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  9.79821e-10  unclonable  1.70129e-08 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  42.86 
 
 
56 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  58.82 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  64.52 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  40.82 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0625  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  48.89 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  9.44878e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  64.52 
 
 
55 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  64.52 
 
 
55 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  55.88 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 
60 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  48.84 
 
 
43 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  52.63 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  52.63 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  1.58972e-07 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 
49 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  67.74 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  64.52 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  48.72 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
49 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  55.88 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>