More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1348 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  100 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  45.79 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  54.35 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  48.3 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  41.34 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  41.34 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  44.22 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  43.54 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.54 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  44.97 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  42.67 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  41.35 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  44.22 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  43.24 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  38.19 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  43.26 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  36.51 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.7 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  43.7 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  34.97 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  40.3 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.88 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  43.61 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  42 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  37.58 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.91 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  42.86 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  40.13 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.18 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.48 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  37.22 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.9 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  43.94 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  36.49 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  39.22 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  36.79 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  43.54 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  34.97 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  35.23 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.31 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  34.84 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  41.04 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  41.28 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  35.75 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  36.76 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  35.75 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.16 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.91 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  40.3 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  39.63 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.12 
 
 		 241 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  41.83 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>