More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1307 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1307  gamma-aminobutyrate permease related permease  100 
 
 		 468 aa  932    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0012668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  55.44 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  55.22 
 
 		 457 aa  507  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0134  amino acid permease  50.41 
 
 		 527 aa  488  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.91384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  54.39 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1747  gamma-aminobutyrate permease or related permease  53.78 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  48.83 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0402  gamma-aminobutyrate permease related permease  49.55 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000611596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0401  gamma-aminobutyrate permease related permease  48.28 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.387816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.91 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.58 
 
 		 468 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.69 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.69 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  42.31 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.91 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.31 
 
 		 467 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.31 
 
 		 467 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  40.14 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  40.14 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.14 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  40.14 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.56 
 
 		 474 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.14 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.36 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.36 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.14 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.36 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.14 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.36 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.17 
 
 		 466 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.38 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.46 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  41.2 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.78 
 
 		 487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.41 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  42.51 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.2 
 
 		 457 aa  325  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.91 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.51 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.51 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.29 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  40.22 
 
 		 503 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  38.91 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  38.6 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  41.73 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  41.73 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  37.3 
 
 		 466 aa  312  9e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  40.91 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  40.66 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2200  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 467 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 502 aa  308  9e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  41.41 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  40.16 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  38.04 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4651  aromatic amino acid transport protein AroP2  40.82 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.06 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  37.31 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  37.29 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  38.36 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  40.86 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  40.62 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  40.62 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  40.62 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  40.62 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  38.36 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  38.36 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  40.62 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  38.36 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  40.62 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  38.36 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  40.62 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3784  amino acid permease-associated region  39.36 
 
 		 473 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000046446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  40.87 
 
 		 456 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  37.9 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1417  amino acid permease-associated region  38.93 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  39.75 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4495  amino acid ABC transporter permease  38.69 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179569  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  38.13 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4001  amino acid permease-associated region  38.96 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070597  hitchhiker  0.0000638701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  38.37 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  37.67 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0967  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695825  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  37.9 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  38.75 
 
 		 451 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  36.42 
 
 		 456 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0933  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  38.32 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  36.85 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  36.42 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  36.42 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0168  aromatic amino acid transporter  36.42 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>