88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1272 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1272  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  100 
 
 
164 aa  337  4e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1316  PTS system sorbose subfamily IIB component  69.94 
 
 
164 aa  237  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.482248  normal  0.251904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3428  PTS system sorbose subfamily IIB component  66.46 
 
 
164 aa  218  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.24846e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3254  PTS system sorbose subfamily IIB component  49.07 
 
 
167 aa  170  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4280  PTS system sorbose subfamily IIB component  43.31 
 
 
164 aa  139  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3008  PTS system sorbose subfamily IIB component  42.33 
 
 
161 aa  133  1e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2097  PTS system sorbose subfamily IIB component  32.89 
 
 
158 aa  73.9  8e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.33 
 
 
324 aa  65.9  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.33 
 
 
324 aa  65.5  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0348  PTS system, IIB component  28.92 
 
 
159 aa  65.5  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  31.33 
 
 
324 aa  65.5  3e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.33 
 
 
318 aa  63.2  2e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1097  PTS system sorbose subfamily IIB component  29.25 
 
 
167 aa  60.5  1e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00631969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2968  PTS system, IIB component  28 
 
 
162 aa  59.7  2e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1675  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25 
 
 
157 aa  59.7  2e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3025  PTS system sorbose subfamily IIB component  32.95 
 
 
150 aa  58.9  3e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3206  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.67 
 
 
164 aa  58.5  4e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.44348e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.83907e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.31359e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.79402e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  29.33 
 
 
313 aa  58.5  4e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  27.52 
 
 
323 aa  58.2  4e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.67 
 
 
323 aa  57.4  9e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  26.85 
 
 
322 aa  56.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  28.67 
 
 
322 aa  56.2  2e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  26.85 
 
 
322 aa  56.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  26.85 
 
 
322 aa  56.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.85 
 
 
322 aa  56.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.85 
 
 
322 aa  56.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.97751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  28.67 
 
 
322 aa  55.8  3e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  26.53 
 
 
320 aa  55.8  3e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3847  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.15 
 
 
158 aa  52.8  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1993  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.97 
 
 
162 aa  53.1  2e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.396142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25 
 
 
329 aa  52.4  2e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  2.59121e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4447  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26 
 
 
157 aa  52  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3323  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26 
 
 
157 aa  52  4e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0567  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26 
 
 
157 aa  52  4e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02998  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIB component of PTS  26 
 
 
157 aa  52  4e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3430  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  26 
 
 
157 aa  52  4e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02949  hypothetical protein  26 
 
 
157 aa  52  4e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3951  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25 
 
 
164 aa  51.2  6e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0135  PTS system sorbose subfamily IIB component  34.69 
 
 
166 aa  50.4  9e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0951  PTS system sorbose subfamily IIB component  40 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0985047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0572  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.33 
 
 
157 aa  50.1  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  25.3 
 
 
323 aa  50.1  1e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  2.26836e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4164  PTS system sorbose subfamily transporter subunit IIB  26.28 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3996  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.28 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3978  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.33 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4050  PTS system sorbose subfamily transporter subunit IIB  26.28 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3613  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  25.33 
 
 
157 aa  50.1  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4101  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.28 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  44.68 
 
 
322 aa  49.3  2e-05  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0379  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  25.83 
 
 
163 aa  49.3  2e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1716  PTS system, IIB component  30 
 
 
165 aa  48.9  3e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3399  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  24 
 
 
155 aa  48.1  5e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00196922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4479  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  26.42 
 
 
164 aa  48.1  5e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.705114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3699  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.32 
 
 
159 aa  47.8  6e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.90287e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3276  PTS system sorbose subfamily IIB component  22.67 
 
 
161 aa  48.1  6e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.93 
 
 
332 aa  47.8  7e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  2.7828e-07  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4944  PTS system IIB component  18.79 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4891  PTS system transporter subunit IIB  18.79 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4790  PTS system, IIB component  18.79 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.674783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3573  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  23.49 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1950  PTS system, IIB component  43.75 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4950  PTS system transporter subunit IIB  18.79 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.315233  normal  0.320869 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1066  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  23.03 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1596  PTS system sorbose subfamily IIB component  20.78 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3863  PTS system sorbose subfamily IIB component  21.38 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0514  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  25.49 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.54817e-15  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0401  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.34 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.16 
 
 
326 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1933  mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  22.09 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.556817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0397  PTS system, IIB component  25.34 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0153  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.47 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.41 
 
 
329 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0688  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.49 
 
 
156 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122681  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  21.92 
 
 
331 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0629  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIB  23.49 
 
 
156 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0117  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  27.78 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.62176e-15  unclonable  1.30149e-28 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0992  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  23.9 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.529927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3579  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  27.36 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.326574 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3374  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  23.9 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0940  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific phosphotransferase enzyme IIB component2  23.9 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  25.16 
 
 
326 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>