48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1254 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1422  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.86 
 
 		 323 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1536  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.58 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.79 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  29.87 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  29.87 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.84 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.86 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.86 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.86 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.86 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.27 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.32 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.84 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.13 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  29.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  24.31 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.39 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.94 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.93 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  27.01 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  24.72 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.13 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.25 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.85 
 
 		 521 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.28 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.31 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  25.31 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.5 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  25.83 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  23.39 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  26.9 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  26.26 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.25 
 
 		 472 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  28.16 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.14 
 
 		 442 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  24.22 
 
 		 212 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.97 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  21.65 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>