More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1213 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  51.13 
 
 
721 aa  696  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  56.49 
 
 
687 aa  706  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
686 aa  1407  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.44 
 
 
685 aa  595  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  44.99 
 
 
775 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  43.03 
 
 
773 aa  538  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.88 
 
 
743 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  36.29 
 
 
680 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  37.08 
 
 
679 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  36.81 
 
 
679 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  36.36 
 
 
680 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  36.36 
 
 
667 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44476e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  36.03 
 
 
680 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  36.72 
 
 
680 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  1.38665e-10 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  36.2 
 
 
673 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  36.2 
 
 
673 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.33103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  36.72 
 
 
680 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  36.89 
 
 
680 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  40.82 
 
 
905 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  35.87 
 
 
706 aa  359  1e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  36.67 
 
 
746 aa  346  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  36.73 
 
 
705 aa  346  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  36.73 
 
 
705 aa  346  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 
705 aa  346  9e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  36.73 
 
 
705 aa  346  9e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  36.56 
 
 
705 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  36.56 
 
 
705 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  36.73 
 
 
705 aa  344  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  35.18 
 
 
746 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.78 
 
 
705 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  35.78 
 
 
705 aa  330  5e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 
795 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.95 
 
 
765 aa  314  3e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.06 
 
 
761 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  34.09 
 
 
880 aa  311  3e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  35.79 
 
 
912 aa  307  4e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.67 
 
 
727 aa  304  4e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 
708 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 
806 aa  296  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 
901 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.03 
 
 
709 aa  290  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  33.55 
 
 
814 aa  288  3e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.19 
 
 
828 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0346  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
863 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 
727 aa  276  1e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 
829 aa  267  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  31.79 
 
 
667 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.22 
 
 
648 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.88 
 
 
683 aa  264  5e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  34.81 
 
 
683 aa  263  7e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.88 
 
 
683 aa  263  7e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.88 
 
 
683 aa  263  9e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.69 
 
 
683 aa  263  9e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.88 
 
 
683 aa  263  9e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.69 
 
 
683 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  35.12 
 
 
683 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 
656 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.49 
 
 
618 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 
843 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.5 
 
 
683 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  32.65 
 
 
720 aa  260  5e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  35.06 
 
 
683 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  35.06 
 
 
683 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  33.76 
 
 
701 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  30.59 
 
 
704 aa  257  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  32.16 
 
 
834 aa  257  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
794 aa  256  1e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  32.32 
 
 
835 aa  256  1e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 
681 aa  255  2e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  34.03 
 
 
723 aa  255  2e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 
744 aa  255  2e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.9 
 
 
642 aa  254  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  32.15 
 
 
820 aa  254  4e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 
941 aa  254  5e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  31.99 
 
 
846 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  31.99 
 
 
834 aa  253  9e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.13 
 
 
791 aa  252  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.47 
 
 
648 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.41 
 
 
646 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.23 
 
 
683 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  33.46 
 
 
833 aa  252  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
727 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
727 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  30.93 
 
 
662 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  33.85 
 
 
779 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  32.04 
 
 
837 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  33.85 
 
 
776 aa  250  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  31.98 
 
 
654 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.96 
 
 
770 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.49 
 
 
734 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.62 
 
 
735 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  30.63 
 
 
693 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.43648e-11  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.36 
 
 
661 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.57 
 
 
761 aa  249  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.72 
 
 
734 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.18 
 
 
642 aa  248  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  30.7 
 
 
732 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  31.21 
 
 
837 aa  247  5e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  30.7 
 
 
643 aa  247  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 
669 aa  246  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>