More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1210 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1210  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
297 aa  617  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0679321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0258  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.24 
 
 
308 aa  373  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1044  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.67 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.920564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0557  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1710  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.02 
 
 
310 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0123  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.27 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0146798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.74 
 
 
293 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1914  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.17 
 
 
308 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1044  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
309 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.222295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1259  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.86 
 
 
293 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1284  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.86 
 
 
293 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1090  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48 
 
 
330 aa  293  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2538  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.190654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3934  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000131356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000036467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3631  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000153453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3648  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000563802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3987  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3938  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3903  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.68 
 
 
304 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000421601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3716  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
304 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1254  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.66 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00603732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.92 
 
 
311 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  45.49 
 
 
309 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  41.86 
 
 
311 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  40.92 
 
 
313 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  40.91 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  39.93 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.94 
 
 
334 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  39.29 
 
 
306 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  41.67 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.75 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  39.2 
 
 
305 aa  215  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.2 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.66 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.66 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  44.19 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  41.61 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0638  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.54 
 
 
297 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  212  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.07 
 
 
323 aa  212  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.87 
 
 
336 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.87 
 
 
328 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.33 
 
 
313 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.87 
 
 
317 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40 
 
 
315 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.85 
 
 
310 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.33 
 
 
313 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  37.46 
 
 
311 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.76 
 
 
312 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39 
 
 
313 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.54 
 
 
308 aa  208  8e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.36 
 
 
328 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.51 
 
 
313 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.22 
 
 
328 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  38.56 
 
 
310 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.48 
 
 
321 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.38 
 
 
324 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  37.86 
 
 
302 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.7 
 
 
305 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.67 
 
 
316 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.34 
 
 
316 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.91 
 
 
318 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40 
 
 
321 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.63 
 
 
334 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.74 
 
 
310 aa  205  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.89 
 
 
324 aa  205  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.15 
 
 
310 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2409  aspartate carbamoyltransferase  37.83 
 
 
340 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.891458  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  41.73 
 
 
314 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.15 
 
 
310 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.28 
 
 
310 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.67 
 
 
335 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.59 
 
 
309 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4569  aspartate carbamoyltransferase  39.46 
 
 
303 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.28 
 
 
319 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  41.29 
 
 
312 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.67 
 
 
316 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  41.44 
 
 
315 aa  202  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.76 
 
 
323 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  39.93 
 
 
313 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  38.91 
 
 
319 aa  202  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  36.96 
 
 
334 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.03 
 
 
311 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.63 
 
 
336 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.14 
 
 
322 aa  201  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  37.26 
 
 
332 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.14 
 
 
322 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.96 
 
 
334 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  36.88 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  35.83 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.14 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.98 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.74 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.93 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.86 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  37.82 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  38.71 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.66 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>