More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1196 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  100 
 
 		 181 aa  360  7.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  56.67 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0978  ribosome recycling factor  62.01 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  58.43 
 
 		 187 aa  197  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  55.19 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  57.06 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  53.25 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 187 aa  177  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  49.44 
 
 		 225 aa  174  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.3 
 
 		 195 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>