More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1063 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1063  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 337 aa  679    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1087  LacI family transcription regulator  38.19 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.42902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1323  transcription regulator of beta-galactosidase gene  37.98 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1949  LacR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.721622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1775  LacI family transcription regulator  32.23 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  34.7 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0714  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002659  beta-D-galactosidase transcriptional repressor  31.75 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.443693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03334  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.43 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  31.86 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02944  DNA-binding transcriptional repressor  31.35 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0626  transcriptional regulator, LacI family  31.35 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3257  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.66 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3369  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  32.2 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0302  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.323775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02894  hypothetical protein  31.35 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0625  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.66 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3542  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.35 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4389  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  31.03 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4137  regulatory protein LacI  29.06 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0977  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0881  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000659595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0793  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0741  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  26.72 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.42 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  26.09 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  26.87 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  26.45 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  28.13 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  26.87 
 
 		 340 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  27.43 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  26.04 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1454  LacI family transcription regulator  25.66 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0012728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0909  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000295634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  25.99 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  23.91 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  27.58 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  25.78 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  24.44 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  24.14 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  25.99 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  24.14 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  24.14 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  24.14 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.58 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  24.17 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  25.58 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  24.14 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  24.72 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  24.32 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  25.28 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  24.32 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  24.32 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.93 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  24.61 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  24.93 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  26.14 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  24.61 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  24.32 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  24.32 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  24.32 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  26.33 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  24.01 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  26.33 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  26.63 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  23.61 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  26.55 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  26.33 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.07 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.07 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.07 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  23.46 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  26.46 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.71 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  26.05 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  24.71 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  25.63 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>