More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0969 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0969  putative threonine efflux protein  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00708139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
208 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.13 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  31.93 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  33.77 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  32.85 
 
 
207 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  32.85 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  32.12 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  32.12 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  32.12 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  32.12 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  31.39 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  32.33 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  29.88 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  26.49 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  26.49 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  26.94 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  31.06 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  28.97 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  31.29 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  32.04 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  26.51 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  27.78 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  27.11 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.46 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.21 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  28.17 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  25.39 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.62 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.83 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.22 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.17 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  28 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.22 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  27.71 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  29.93 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  27.08 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  25.97 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  25.97 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3717  lysine exporter protein LysE/YggA  25.85 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.84 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4194  lysine exporter protein LysE/YggA  26.21 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288447  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  29.1 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.26 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  32.12 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.22 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.82 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.49 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  27.97 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  27.97 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  29.79 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.63 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  27.21 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.26 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  25.15 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.52 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.3 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.87 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.7 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  33.57 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  25.97 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  32.35 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  27.98 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  27.97 
 
 
208 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.94 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  27.18 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.34 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>